双方还约定，顺风光电应尽快向中科恒源支付总投资额的10%（5000多万元），顺风光电也应出具就平罗中电科履约付款义务的履约保证函。
不过，事情并未像想象中那么顺利。
据中科恒源表示，此后其并没有收到实际款项。“我们拿到了商业汇票，但是在银行查询时，顺风光电的银行账户上并没有钱，只是白纸一张。”
顺风光电前述高管则透露，顺风光电一共给中科恒源支付过两次款项。第一次是通过国开行的贷款方式来操作的，这笔钱是去年顺风光电和中科恒源合作的电站项目质保金，总计4300万元，本应在并网一年后（2015年）交给中科恒源，但考虑到后者急需用钱采购一些产品，便提前支付给了中科恒源。
但是，中科恒源并不承认这笔钱，“他们认为顺风光电还应继续支付平罗项目的资金，因此我们又继续打给对方商业汇票4000万元。”前述顺风光电高层表示，在这一过程中，也就是今年5~6月份，彼此发生了矛盾，到了7月顺风光电自行将第二笔商业汇票抽回，不再与中科恒源合作。
今年8月，中科恒源忽然发现顺风光电引入了第三方施工公司——西安东庆，随后向各方（包括政府）发函，要求有关方面尽快介入，但结果并不理想。9月1日，该公司继续向有关方面反映情况，还是没有得到满意的答复。