煤炭资源税税率幅度为2%~10%，具体适用税率由省级财税部门在上述幅度内，根据本地区清理收费基金、企业承受能力、煤炭资源条件等因素提出建议，报省级人民政府拟定。结合当前煤炭行业实际情况，现行税费负担较高的地区要适当降低负担水平。
此外，对衰竭期煤矿开采的煤炭，资源税减征30%；对充填开采置换出来的煤炭，资源税减征50%。
2011年以来，煤炭资源税一直是能源领域资源税改“拖后腿者”。争议和分歧始终存在，此前未有突破。中央财经大学学者邢雷曾对《第一财经日报》记者称，最好还是“清费立税”，地方确定具体税率。
收费清理也被财政部通知点名，要求取消煤炭可持续发展基金收费(山西省)、原生矿产品生态补偿费(青海省)、煤炭资源地方经济发展费(新疆维吾尔自治区).
但涉煤收费非常复杂，本报记者了解的情况是，山东省的各项收费累计占到煤价的三分之一，企业负担沉重。
煤炭大省山西，则更名目繁多。公开资料显示，2012年煤炭行业贡献了山西省财政收入的四成左右。
山西清理涉煤收费的文件显示，收费项目共计25项。一位山西某市煤炭企业人士对本报记者分析说，各家煤炭企业的成本不尽相同，涉煤收费占煤价的比例应不低于三分之一，山西财政对煤炭行业的依赖性很强，清费肯定是逐渐的过程。
